Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR1BP42025 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms