Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms