Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms