Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms