Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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