Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT3P12035 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT3P12035 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT3P12035 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT3P12035 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT3P12035 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT3P12035 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT3P12035 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT3P12035 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT3P12035 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT3P12035 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT3P12035 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT3P12035 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT3P12035 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KRT3P12035 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KRT3P12035 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KRT3P12035 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KRT3P12035 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT3P12035 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT3P12035 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms