Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HKR1P10072 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HKR1P10072 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms