Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms