Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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PDE6DO43924 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PDE6DO43924 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PDE6DO43924 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PDE6DO43924 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PDE6DO43924 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PDE6DO43924 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDE6DO43924 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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