Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGTAO43765 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGTAO43765 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms