Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT7O43581 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT7O43581 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT7O43581 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT7O43581 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT7O43581 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT7O43581 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT7O43581 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT7O43581 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT7O43581 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT7O43581 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT7O43581 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms