Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TSPAN4O14817 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TSPAN4O14817 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TSPAN4O14817 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TSPAN4O14817 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TSPAN4O14817 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TSPAN4O14817 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TSPAN4O14817 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TSPAN4O14817 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TSPAN4O14817 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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TSPAN4O14817 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TSPAN4O14817 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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