Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms