Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC2Q9Y235 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms