Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF2Q9UNY4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms