Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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RABGEF1Q9UJ41 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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RABGEF1Q9UJ41 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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RABGEF1Q9UJ41 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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RABGEF1Q9UJ41 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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RABGEF1Q9UJ41 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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RABGEF1Q9UJ41 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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RABGEF1Q9UJ41 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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RABGEF1Q9UJ41 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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RABGEF1Q9UJ41 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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