Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms