Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms