Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms