Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2AFJQ9BTM1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms