Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LGMNQ99538 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGMNQ99538 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms