Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms