Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms