Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS8Q8N3P4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms