Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDXQ7Z353 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms