Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms