Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC73Q6ZRK6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms