Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
METAP1DQ6UB28 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
METAP1DQ6UB28 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
METAP1DQ6UB28 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
METAP1DQ6UB28 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
METAP1DQ6UB28 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
METAP1DQ6UB28 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
METAP1DQ6UB28 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
METAP1DQ6UB28 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
METAP1DQ6UB28 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
METAP1DQ6UB28 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms