Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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