Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q6Q795 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q6Q795 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms