Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAPCD1Q5SSQ6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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