Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms