Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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VAMP3Q15836 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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