Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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