Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms