Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTTNQ14247 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTTNQ14247 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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