Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL9A2Q14055 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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