Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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