Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM32Q13049 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms