Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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