Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.494e-9■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DNAJB14-205ENST00000442697 6075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.512e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 CCT3-203ENST00000368258 1885 ntTSL 211.38□□□□□ -0.592e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ATP5G1-204ENST00000503641 539 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.592e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 CCT3-212ENST00000478640 583 ntTSL 211.28□□□□□ -0.62e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RPAIN-214ENST00000574003 561 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.612e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DNAJB14-204ENST00000426476 662 ntTSL 311.25□□□□□ -0.612e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 LINC00969-212ENST00000445430 4208 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.632e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ANKRD46-202ENST00000358990 661 ntTSL 311.08□□□□□ -0.642e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ATP5G1-205ENST00000504591 401 ntTSL 210.58□□□□□ -0.722e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ATP5G1-206ENST00000506855 468 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.722e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ATP5G1-209ENST00000514808 359 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.722e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DOCK6-207ENST00000587656 4009 ntTSL 510.51□□□□□ -0.734e-9■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 UCHL5-210ENST00000421683 834 ntTSL 310.51□□□□□ -0.732e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ATP5G1-201ENST00000355938 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.742e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RPAIN-204ENST00000405578 1083 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.742e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RPAIN-212ENST00000573126 2728 ntTSL 210.36□□□□□ -0.752e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 NDUFB1-206ENST00000605997 336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.772e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 PAWR-207ENST00000549050 547 ntTSL 510.04□□□□□ -0.88e-12■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ATP5G1-202ENST00000393366 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.812e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MAP2K1-203ENST00000566326 1432 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.832e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ANKRD46-206ENST00000520552 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.862e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ANKRD46-207ENST00000520713 1327 ntTSL 1 (best)9.68□□□□□ -0.862e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 KDM4A-201ENST00000372396 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.862e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 PPIL4-201ENST00000253329 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.92e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DNAJB14-201ENST00000334223 2617 ntTSL 1 (best)9.38□□□□□ -0.912e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DNAJB14-202ENST00000398991 842 ntTSL 59.25□□□□□ -0.932e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 LRMDA-201ENST00000372499 899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.952e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -12e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ATP5G1-207ENST00000513347 2214 ntTSL 28.67□□□□□ -1.022e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 GMDS-AS1-204ENST00000525811 539 ntTSL 28.38□□□□□ -1.072e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 AKAP8L-210ENST00000596195 553 ntTSL 48.34□□□□□ -1.072e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 CCT3-208ENST00000415548 513 ntTSL 38.32□□□□□ -1.082e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.112e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 CPE-205ENST00000513982 564 ntTSL 47.97□□□□□ -1.133e-8■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RPAIN-215ENST00000575112 3817 ntTSL 27.97□□□□□ -1.132e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DOCK6-215ENST00000592463 280 ntTSL 1 (best)7.75□□□□□ -1.174e-9■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.192e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 CCT3-215ENST00000496684 748 ntTSL 27.47□□□□□ -1.212e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 CCT3-216ENST00000533194 581 ntTSL 37.27□□□□□ -1.252e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MCM3AP-205ENST00000479557 364 ntTSL 26.44□□□□□ -1.382e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.382e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ANKFY1-205ENST00000572412 3352 ntTSL 26.23□□□□□ -1.412e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.482e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 ANKRD46-209ENST00000523000 567 ntTSL 45.77□□□□□ -1.492e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 C16orf72-202ENST00000574285 10359 ntTSL 25.72□□□□□ -1.492e-16■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 CCT3-207ENST00000413555 842 ntTSL 55.5□□□□□ -1.532e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 URI1-203ENST00000570564 514 ntTSL 45.41□□□□□ -1.542e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 FAF2-203ENST00000506061 337 ntTSL 35.35□□□□□ -1.552e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 CCT3-209ENST00000446905 593 ntTSL 34.86□□□□□ -1.632e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 CCT3-214ENST00000490221 696 ntTSL 24.84□□□□□ -1.632e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 PPP4R3B-202ENST00000482826 435 ntTSL 24.8□□□□□ -1.642e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.662e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.55□□□□□ -1.682e-16■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 CCT3-210ENST00000463132 610 ntTSL 34.19□□□□□ -1.742e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.792e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 SRPK1-207ENST00000505885 566 ntTSL 23.35□□□□□ -1.874e-9■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DNAJB14-208ENST00000471101 4799 ntTSL 22.28□□□□□ -2.042e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 DNAJB14-203ENST00000420137 3442 ntTSL 1 (best)1.78□□□□□ -2.122e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 TMEM143-211ENST00000600816 810 ntTSL 216.08■□□□□ 0.162e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.092e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.212e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 AC011476.3-201ENST00000593060 786 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.15e-7■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.071e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MBTD1-202ENST00000405860 3224 ntTSL 511.72□□□□□ -0.531e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MBTD1-206ENST00000591270 2163 ntTSL 24.9□□□□□ -1.621e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 EIF4B-210ENST00000550704 1476 ntTSL 514.12□□□□□ -0.152e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 EIF4B-205ENST00000549481 1097 ntTSL 513.06□□□□□ -0.322e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 EIF4B-203ENST00000420463 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.542e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 EIF4B-202ENST00000416762 1985 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.672e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.192e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.742e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.252e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.868e-8■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.848e-8■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 C22orf39-204ENST00000509549 2979 ntTSL 211.74□□□□□ -0.538e-8■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 HIRA-203ENST00000452818 453 ntTSL 511.09□□□□□ -0.638e-8■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 HIRA-204ENST00000464189 560 ntTSL 411.09□□□□□ -0.638e-8■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 PCBP2-218ENST00000550585 2543 ntTSL 58.39□□□□□ -1.071e-23■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 CPNE1-207ENST00000414664 1070 ntTSL 525.11■■□□□ 1.613e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 CPNE1-217ENST00000439669 784 ntTSL 523.89■■□□□ 1.413e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 CPNE1-220ENST00000458038 596 ntTSL 321.55■■□□□ 1.043e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 CPNE1-211ENST00000420363 821 ntTSL 221.21■□□□□ 0.993e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 CPNE1-219ENST00000440240 746 ntTSL 520.74■□□□□ 0.913e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 CPNE1-210ENST00000416778 744 ntTSL 217.79■□□□□ 0.443e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 CPNE1-213ENST00000434795 831 ntTSL 317.79■□□□□ 0.443e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.193e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 CPNE1-208ENST00000414711 673 ntTSL 515.81■□□□□ 0.123e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 CPNE1-215ENST00000437100 826 ntTSL 514.54□□□□□ -0.083e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 CPNE1-206ENST00000412056 998 ntTSL 313.78□□□□□ -0.23e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 CPNE1-214ENST00000435747 400 ntTSL 310.32□□□□□ -0.763e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 AL109827.1-202ENST00000441563 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.93□□□□□ -0.823e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 AL109827.1-201ENST00000454607 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.93□□□□□ -0.823e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 CPNE1-218ENST00000439806 748 ntTSL 59.82□□□□□ -0.843e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.862e-6■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 DENR-204ENST00000539463 671 ntTSL 225.67■■□□□ 1.72e-6■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.032e-6■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.053e-6■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.423e-6■■□□□ 12.3
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