Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms