Protein–RNA interactions for Protein: Q08881

ITK, Tyrosine-protein kinase ITK/TSK, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITKQ08881 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITKQ08881 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITKQ08881 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITKQ08881 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITKQ08881 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITKQ08881 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITKQ08881 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITKQ08881 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITKQ08881 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITKQ08881 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITKQ08881 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITKQ08881 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITKQ08881 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms