Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms