Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms