Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms