Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms