Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCS1P62166 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCS1P62166 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCS1P62166 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCS1P62166 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCS1P62166 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NCS1P62166 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NCS1P62166 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCS1P62166 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCS1P62166 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCS1P62166 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCS1P62166 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCS1P62166 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCS1P62166 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCS1P62166 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCS1P62166 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCS1P62166 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCS1P62166 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCS1P62166 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCS1P62166 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NCS1P62166 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCS1P62166 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCS1P62166 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCS1P62166 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCS1P62166 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCS1P62166 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCS1P62166 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCS1P62166 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCS1P62166 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms