Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEMP55040 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEMP55040 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEMP55040 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms