Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBP2P50120 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBP2P50120 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBP2P50120 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBP2P50120 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBP2P50120 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBP2P50120 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RBP2P50120 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBP2P50120 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBP2P50120 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms